Mélanie Courtot

IORC, Université de Toronto
La Pre Mélanie Courtot est directrice de l’informatique génomique et chercheuse principale à l’Institut ontarien de recherche sur le cancer à Toronto, et professeure adjointe au Département de biophysique médicale de l’Université de Toronto.
Elle se passionne pour l’informatique translationnelle, c’est-à-dire par la construction de systèmes intelligents permettant d’acquérir de nouvelles connaissances et d’influer sur la santé humaine. Son laboratoire vise à construire un écosystème de connaissances partagé à l’échelle mondiale afin de faire progresser la science et d’améliorer la santé de tous, ce qui nécessite des données de haute qualité, des processus d’intégration de données robustes à grande échelle et des plateformes de découverte permettant l’accès aux données au-delà des frontières internationales. À l’IOCR, son équipe de 25 personnes s’occupe du développement de la suite logicielle Overture, laquelle a permis de gérer environ trois millions de génomes (2,5 pétaoctets de données) auxquels ont eu accès plus de 300 000 chercheurs dans le monde entier. Overture soutient de nombreux projets actifs de génomique du cancer à grande échelle, notamment ICGC et ICGC-ARGO (qui recueillent des données moléculaires et cliniques de plus de 100 000 patients dans le monde), VirusSeq (portail canadien de la COVID avec plus de 500 000 séquences du SARS-CoV-2), et la future Bibliothèque génomique pancanadienne. Elle gère également la plateforme de partage et d’archivage des données sur les agents pathogènes en Afrique, laquelle permet de télécharger et de partager des séquences d’agents pathogènes et les métadonnées connexes dans toute l’Afrique continentale.
Après l’obtention de sa maîtrise en informatique en France en 2002, la Pre Courtot a travaillé comme ingénieure en logiciels et administratrice de base de données pendant plusieurs années en France, au Royaume-Uni, en Grèce et au Canada. Elle a obtenu son doctorat en bio-informatique à l’Université de la Colombie-Britannique en 2014, suivi d’une bourse de recherche postdoctorale en santé publique. La Pre Courtot codirige le groupe de travail clinique et phénotypique et les groupes de représentation de l’utilisation des données et des cohortes pour l’Alliance mondiale pour la génomique et la santé, ainsi que les activités d’harmonisation des cohortes pour le Consortium international des cohortes HundredK+. Elle est membre du conseil consultatif de la coalition Public Health Alliance for Genomic Epidemiology, du projet European Open Science Cloud for Cancer et de la plateforme scientifique de données ouvertes eLwazi. En 2024, elle s’est jointe au Conseil des chercheurs de l’Alliance de recherche numérique au Canada afin de conseiller l’Alliance sur l’élaboration de sa vision stratégique et de ses priorités pour servir au mieux la communauté des chercheurs canadiens.