[Montréal, Québec] — La Bibliothèque génomique pancanadienne (BGP), hébergée à l’Université McGill, annonce aujourd’hui une étape déterminante dans la mise en œuvre de l’infrastructure génomique nationale du Canada grâce à l’intégration prévue des données de l’initiative HostSeq de CGEn et de la Biobanque québécoise de la COVID‑19 (BQC19). Cette réalisation marque un moment clé dans la transformation des actifs génomiques de calibre mondial du Canada en une ressource nationale coordonnée, accessible et porteuse d’impact.
Cette intégration rassemblera deux des initiatives génomiques canadiennes les plus marquantes de l’ère COVID-19. HostSeq a été lancé en réponse à la pandémie de COVID‑19 par CGEn, la plateforme nationale de séquençage et d’analyse du génome au Canada, en collaboration avec des partenaires partout au pays. HostSeq constitue une ressource nationale de séquençage complet du génome qui relie des données génomiques et cliniques provenant de plus de 10 000 personnes vivant au Canada. CGEn et son établissement principal, The Hospital for Sick Children (SickKids), ont officiellement signé une entente permettant l’intégration des données HostSeq au PCGL. BQC19, la biobanque provinciale de la COVID‑19 du Québec, contribue également ses données de séquençage du génome entier à l’intégration au PCGL. Cette biobanque a généré des échantillons biologiques profondément annotés et des données associées, reflétant le leadership de longue date du Québec en matière de biobanques et de recherche collaborative.
Concrétiser une vision nationale pour la génomique
Cette étape concrétise la vision du gouvernement du Canada pour la BGP : dépasser les ensembles de données fragmentés et propres à des projets afin de bâtir un écosystème génomique pancanadien cohérent. Elle s’inscrit également dans les priorités de la Stratégie canadienne en matière de génomique d’ISDE, en améliorant l’accès aux données génomiques, en renforçant la coordination au sein de l’écosystème et en transformant la recherche génomique en avantages concrets pour la santé, l’économie et la société canadienne.
Avec l’intégration prévue de HostSeq et de BQC19 à la BGP, cette étape marque la création d’un actif national précieux, offrant un point d’accès fiable qui favorise l’excellence en recherche, la transformation des systèmes de santé et l’innovation à grande échelle.
« D’importants investissements ont été réalisés au Canada au cours des deux dernières décennies pour générer des milliers de génomes humains », dit Guillaume Bourque, professeur de génétique humaine à l’Université McGill et responsable de la BGP. « Cependant, pour tirer pleinement parti de cette information précieuse, nous avons besoin d’outils comme la BGP qui permettront un accès à long terme et faciliteront la recherche et l’innovation. »
« La BGP a été conçu avec la gouvernance au cœur de sa mission. Des règles claires et une responsabilité partagée sont ce qui permet la mise en commun et la réutilisation des données génomiques à grande échelle », explique Ma’n H. Zawati, professeur agrégé et co-responsable de la BGP. « L’intégration réussie de HostSeq et BQC19 démontre que les projets peuvent se joindre à la BGP en toute confiance, sachant que leurs données seront gérées de façon responsable et dans l’intérêt public. »
« L’intégration de HostSeq et de BQC19 à la Bibliothèque génomique pancanadienne représente une étape majeure pour la recherche en génomique au Canada, » dit Dominique Bérubé, Vice-rectrice, Recherche et innovation à l’Université McGill. « En réunissant ces données génomiques au sein de la BGP, cette ressource nationale pourra mieux soutenir l’accélération des découvertes scientifiques et favoriser de futures percées en recherche en santé. »
« En tant que cohorte inaugurale, HostSeq contribue à élaborer les processus d’ingestion, d’analyse et d’accès aux données de la BGP. Ce cadre initial est le fruit d’un solide effort de collaboration entre le CGEn et la BGP, et aidera à préparer la BGP à l’intégration future de données ainsi qu’au partage de données génomiques de haute qualité afin de soutenir des recherches essentielles et opportunes dans de nombreux domaines de la santé », affirme Meredith McLaren, PDG de CGEn, la plateforme nationale du Canada pour le séquençage et l’analyse du génome. « CGEn est enthousiaste à l’idée de contribuer à cet atout extrêmement important pour les chercheurs canadiens pour les années à venir. »
« Le partage des ressources est au cœur de la mission de BQC19. Nous sommes donc très heureux de contribuer à la BGP, une initiative nationale essentielle pour la communauté scientifique », disent Madeleine Durand et Simon Rousseau, codirecteurs de BQC19. Ce type de collaboration est crucial pour relever les défis de santé auxquels font face les Canadiennes et les Canadiens. Nous sommes convaincus que la BGP ouvrira la voie à une meilleure intégration et à un partage accru des données en santé humaine. »
Fondée en 1821, l’Université McGill accueille des étudiants, des professeurs et des employés d’exception de partout au Canada et du monde entier. Année après année, elle se classe parmi les meilleures universités du Canada et du monde. Établissement d’enseignement supérieur de renommée mondiale, l’Université McGill exerce ses activités de recherche dans trois campus, 11 facultés et 13 écoles professionnelles ; elle compte 300 programmes d’études et au-delà de 40 000 étudiants, dont plus de 10 200 aux cycles supérieurs.
CGEn est une plateforme nationale de séquençage et d’analyse du génome financée par le gouvernement fédéral. Créé en 2015, CGEn compte plus de 200 employés et est principalement financé par la Fondation canadienne pour l’innovation (FCI) par l’intermédiaire de son Fonds des initiatives scientifiques majeures (FISM), en tirant parti d’investissements des gouvernements provinciaux de l’Ontario, du Québec et de la Colombie-Britannique, de Génome Canada, ainsi que d’autres partenaires.
CGEn fonctionne comme une plateforme nationale intégrée avec des nœuds à Toronto (The Centre for Applied Genomics au Hospital for Sick Children), à Montréal (Centre McGill de génomique à l’Université McGill) et à Vancouver (Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre à la Provincial Health Services Authority). L’organisme dirige des projets de grande envergure et offre des services génomiques avancés afin de soutenir la recherche dans les sciences de la santé, l’agriculture, la foresterie, les pêches, l’environnement, la biodiversité et d’autres secteurs d’importance pour le Canada.
HostSeq est une initiative nationale canadienne, dirigée par CGEn, dans le cadre du Réseau canadien de génomique de la COVID-19 (CanCOGeN) de Génome Canada. Elle regroupe des données de séquençage génomique provenant de 15 études de recherche sur la COVID-19 ainsi que des informations cliniques sur plus de 10 000 Canadiens, créant ainsi une banque de données génomiques et cliniques. HostSeq a été lancé pour offrir aux chercheurs un ensemble de données riche permettant d’analyser et d’identifier les déterminants génétiques qui influencent la santé dans une perspective canadienne.
La Biobanque québécoise de la COVID-19 (BQC19) est une initiative provinciale visant à recueillir, conserver et partager des données et des échantillons provenant de patients atteints de formes légères ou sévères de la COVID-19, ainsi que de sujets témoins. BQC19 a été créée pour garantir aux chercheurs un accès optimal aux matériaux biologiques et aux données nécessaires à la recherche sur la COVID-19.